1.癥狀 與一般急性細菌肺炎相似。如發熱、寒戰、畏寒、咳嗽、咯膿痰或白痰，胸痛等。但對于原有肺部疾病等的繼發性肺炎，癥狀不典型，可表現為呼吸衰竭，心衰或原發病癥狀加劇，或高熱，咳痰增多。嚴重病人可出現感染性休克，敗血癥等并發癥癥狀。
2.體征 雙肺可有濕性啰音，當炎癥浸潤出現肺段或葉實變時，在相應肺段葉部位出現語顫增強。
叩濁，可聞及支氣管呼吸音，部分病人有呼吸急促、發紺、血壓下降。
摩根菌肺炎的診斷要根據臨床表現、胸片和病原體檢查結果綜合判斷。臨床上對有發熱、畏寒、咳嗽、咳黃痰或白痰、氣促，胸痛，查體雙肺有濕性啰音，胸片示雙肺葉、段性浸潤陰影，或有肺膿腫形成，外周血象示白細胞和中性粒細胞增高，痰液涂片革蘭染色有大量陰性桿菌，應考慮該病可能。對于醫院獲得性肺炎，因原發病存在，肺炎癥狀不典型。但如出現下列表現：在原發病基礎上突然高熱;咳嗽咳痰加劇;不明原因的呼吸衰竭和心衰;胸片示雙肺浸潤陰影或在原病灶基礎上出現新的浸潤病灶;結合痰中有大量革蘭陰性桿菌，也應考慮有本病可能。應反復查痰、血或直接下呼吸道分泌物培養。凡連續2次或2次以上痰培養均為摩根菌;或痰和血、或胸腔積液均培養出摩根菌;或直接呼吸道分泌物培養出摩根菌;或生前痰培養和死后從肺部均分離出摩根菌，結合上述表現及胸片結果即可確診。但對于原發性或繼發性摩根肺炎，臨床上有時難以區別，一般認為凡在原發肺病等基礎上出現摩根菌感染，為繼發性肺炎。
