揭陽市慈云醫院成立于1996年9月，首期工程2萬余平方米，由香港慈云閣董事局捐資2000余萬元興建，歷經20年發展，已具一定規模，2015年7月經南方醫科大學批準成為“南方醫科大學第三附屬醫院粵東醫院”。醫院是一所集醫療、教學、科研為一體的市直公立綜合醫院，是市直及各縣（市、區）、省內異地醫保即時結算定點醫院。
醫院地處市區中心，四周環路。距揭陽潮汕國際機場、潮汕高鐵站20余公里，距醫院30公里半徑、30分鐘車程范圍內人口330萬，區位優勢明顯。
醫院規模醫院占地43000余平方米，現有建筑面積6.4萬平方米，開放床位520張。醫院功能完善，學科齊全，現有揭陽市優秀專家和拔尖人才2人，擔任揭陽市醫學會各專業分會副主委以上職務4人，另有南方醫科大學第三附屬醫院派駐專家10余人。開設有急診科、綜合科、門診部、健康體檢中心、內一科（呼吸、腎內、糖尿病、內分泌）、內二科（心血管、消化、神經內科）、ICU、兒科、普外、骨科、神經外科、婦產科、疼痛科、口腔科、眼科、耳鼻咽喉科、手術室、麻醉科、影像中心、超聲科、內鏡室、心電圖室、腦電圖室、體外碎石室、激光室、檢驗科、病理科等。
醫療設備主要設備有美國原裝進口的飛利浦全系列高端影像設備：64排128層微平板CT、1.5T核磁共振（MR）、大平板DSA、無線平板雙子星DR、飛利浦Iu Elite矩陣四維彩超等。還有美國GE飛天Ⅲ DR、日本阿洛卡F37陰式彩超、德國費森尤斯血透機、德國貝朗CRRT、德國德爾格呼吸機、德國卡瓦口腔全景片機、種植牙系統、美國貝克曼全自動生化儀及日本奧林巴斯支氣管鏡、胃鏡、結腸鏡等。層流手術室系統、美國MAQUET多功能手術床、德國奇目Vision C臂、德國STORZ高清腹腔鏡及宮腔鏡、德國Arthrex關節鏡、德國德爾格麻醉機等。
醫療技術目前內科系統能開展支氣管鏡檢查及鏡下治療，呼吸機治療，經皮肺、肝、腎、淋巴結等穿刺活檢術，血液透析，床邊連續腎臟替代療法，中心靜脈永久透析管置入術，人造血管移植動靜脈造瘺術，心臟起搏器植入術，心肌梗死及腦梗死的靜脈溶栓，腦出血的微創顱內血腫清除術，糖尿病的胰島素泵強化治療，外周介入診療技術等；外科系統能開展甲狀腺手術，乳腺癌根治術，胃癌根治術，結腸癌根治術，重度痔瘡PPH手術，腹腔鏡膽囊摘除術及膽總管切開取石術，經皮腎鏡取石術，前列腺汽化電切術，腦外傷開顱血腫清除術，髖、膝、肩關節置換術，關節鏡下微創治療，脊柱相關手術、椎間盤微創介入治療，斷指、斷肢再植術等；婦科以內鏡微創為特色，可開展腹腔鏡下惡性腫瘤根治術、全子宮切除術、子宮肌瘤剔除術、卵巢瘤及卵巢囊腫剔除術、宮外孕病灶切除及開窗取胚治療術等微創手術；產科能開展正常分娩、各種難產、剖宮產、無痛分娩術及妊娠合并內外科疾病治療。口腔科能開展正畸、種植牙等；眼耳鼻咽喉科能開展白內障超聲乳化人工晶體植入術、青光眼手術、鼻內窺鏡手術、乳突根治術等。
改革發展為實現醫院的跨越發展，近年我院積極實施“引民資、攀名院”戰略。在“保持全民所有制事業單位性質不變、非營利性醫院性質不變”等6不變的前提下，先后引進廣東萊斯投資集團、北京綠旗集團、九鼎投資等資本，擬在2020年前投資7億元人民幣將醫院擴建成2300張病床規模的三級甲等綜合醫院。目前，投入3億余元、建筑面積5萬平方米的新門急診綜合樓已完工并投入運行；2016年底，樓高99米、23層、建筑面積12萬平方米、可開放1800張病床的住院大樓將開工建設。
2014年7月23日南方醫科大學第三附屬醫院與我院簽訂了長期、全面、緊密的幫扶合作協議，并派出了多學科的專家團隊長駐我院，致力將我院打造成以骨科為龍頭，心臟、婦產、腎病為重點的三級甲等綜合醫院。
