法洛四聯癥患兒的預后關鍵決策于肺動脈狹窄水平及側支循環狀況，危重癥四聯癥有25%～35%在1歲內身亡，50%患者喪生于3歲內，70%～75%喪生于10歲內，90%患者會夭亡，主要是因為漫性氧氣不足造成，紅細胞增多癥，造成繼發性心肌肥大和心力衰竭而身亡。
法洛四聯癥普遍的欠佳病發癥，關鍵包含：腦栓塞，多產生在2歲之內的患者，原因為因為病人長期性紫紺氧氣不足，紅細胞增多，血液黏稠度提高，血液遲緩產生靜脈血栓引發。腦膿腫，多產生于2歲以上的患者。
可能是靜脈血中被病菌感染的栓子由分離位置進到頭部，或由于腦血液降低，腦組織氧氣不足，造成部分腦組織變軟而繼發性感染，患者常主要表現為發熱，頭痛，嘔吐，總想睡覺或抽動及偏癱等。此外，因為法洛四聯癥患者心臟內存有出現異常安全通道，使血流動力學改變，非常容易產生贅物而引起感染性心內膜炎。
患者生長發育語言發育遲緩，經常出現杵狀指、趾，多在紫紺出現幾個月或多年后產生。肩胛骨左緣第2～4肋間可聽見不光滑的噴涌樣收縮期雜聲，長伴收縮期細震顛。極比較嚴重的右心室排出道梗塞或肺動脈鎖閉病案可無心臟雜聲。在胸口部或背部有持續性雜聲時，表明有豐富多彩的側支血管存有，肺動脈瓣第二心音顯著變弱或消退。
