虹膜異色癥的出現，可以分成先天和后天兩方面。
先天方面，主要是兩眼虹膜顏色不同的情況，有可能於遺傳有關。由于眼睛虹膜的顏色受遺傳影響，假若后代的父母其中一位有藍眼睛，而另一位則有灰色眼睛的話，那兩位的后代有可能有一對藍色的眼睛、或一對灰色的眼睛，但亦有可能一邊眼的虹膜是藍色，而另一邊卻是灰色的。這可能與瓦登伯革氏癥候群(Waardenburg Syndrome)或Piebald Syndrome相關。
后天的情況有可能是因為患上Horner Syndrome或虹膜毛樣體炎，使虹膜造成損傷而萎縮。
虹膜顏色的變化：
1、發炎期：出現在虹膜的各部位，呈金黃色，表示體內有發炎的癥狀。
2、次發炎期：區域呈茶褐色。
3、慢性期：暗褐色，表示該反射區組織器官已有功能衰退的現象。
4、退化期：呈深黑色，表示該反射組織器官大部分已失去功能，亦有可能會形成組織病變，尤其應注意腫瘤的形成。
后天的情況造成虹膜藍色癥狀的預防與調養：
1.嚴格遵循醫囑用藥治療。
2.心情舒暢.防止急躁，充分睡眠有利疾病痊愈。
3.飲食宜清淡、富含維生素食品。
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