一、發病原因
1.CVID可能的分子遺傳學機制 雖然大多數CVID患兒為散發病例，但也有部分病例有家族史，特別是與選擇性IgA缺陷患者發生于同一家庭。推測CVID和選擇性IgA缺陷病是由于某個或某幾個基因突變或缺失所致，只是目前尚不能明確而已。
(1)第6對染色體：MHCⅢ補體基因C4A基因缺乏，并常有特殊的HLA或TNF-α基因多態性;MHCⅡ的DQ位點多態性與該病有關，可能是其候選基因組。
(2)第9對染色體：PAX5基因編碼B細胞-特異性活化蛋白(BSAP)，影響免疫球蛋白的類別轉換;該基因失活可致小鼠免疫球蛋白缺陷，尚無資料表明也引起人類疾病。
(3)第18對染色體缺失可發生CVID。
2.B細胞缺陷。
3.T細胞缺陷 許多CVID的發病與T細胞功能缺陷密切相關，包括T細胞對B細胞的輔助不足或對B細胞的直接抑制。25%～30%的病例CD8+T細胞增多或CD4+T細胞減少，CD4/CD8 T細胞比值下降。超過1/3的患者血清IL-4、IL-6、neopterin和可溶性CD8分子升高，IL-10水平可能下降。大約40%的患者T細胞表達CD40配體(CD40L，gp39)明顯下調，可能與其發病機制有關。
二、發病機制
1.發病機制 引起低Ig血癥的機制尚不完全清楚，多數學者認為該病為一組病因不同的臨床綜合征，有以下幾種可能：
(1)Th功能缺陷：多數CVID患者外周血B細胞數量和功能均無異常，但Th數量和功能低下，不能向B細胞提供輔助信息，以致B細胞終期分化受阻。這些患者的Th分泌的IL-2、IL-4、IL-6、IL-10、IFN-γ、B細胞生長因子(BCGF)和B細胞分化因子(BCDF)均明顯不足。個別患者CD40L表達障礙。
(2)B細胞功能缺陷：B細胞數量下降、增殖反應低下，不能分化為產生Ig的漿細胞。少數病例可有漿細胞，但也缺乏合成分泌Ig的能力。T細胞數量和功能正常。B細胞存在的內在缺陷使其完全不能分泌免疫球蛋白或僅能分泌IgM，不能向IgG轉換。導致B細胞功能障礙的確切機制尚不清楚。
(3)Ts功能亢進：少數患者的Ts功能亢進，抑制B細胞分化過程。
(4)抗B細胞自身抗體：極少數患者血清存在抗自身B細胞的抗體，可能是抑制B細胞分化功能的原因。
該病的遺傳基礎尚不清楚，大多數為散發病例，但家族成員中常有IgA和(或)IgG亞類缺陷病以及自身免疫性疾病患者。CVID患者常具有HLA-DR3、HLA-B8和complotype SCOI抗原，而家族成員則常具有HLA-DR1、HLA-Bω65、complotype SC2，HLA-DR7、HLA-Bω67、complotype SC61以及HLA-DR7、HLA-B44和complotype FC31半合子。
CVID患者的Ig的糖成分不能結合到Ig分子上。有的患者是T淋巴細胞抑制了Ig的合成。血清Ig缺陷的程度不如X-連鎖低丙種球蛋白血癥顯著。血循環中B淋巴細胞數量正常或減低。周圍淋巴組織可有濾泡結構破壞，網狀細胞和皮質濾泡增生。
2.病理改變 CVID的病理改變可分為兩種類型：
(1)淋巴組織增生型：多見于以T細胞缺陷為主者。
(2)淋巴組織發育不良：多見于以B細胞缺陷為主者。
在接受抗原刺激后，該兩型均缺乏漿細胞增生。有人認為這兩種類型也可能是同一疾病的不同階段表現。消化道受累者的小腸絨毛萎縮和扁平。
