一、發病原因
兒童學校恐怖癥與下述因素有關：
1.重新回到學校難以適應 孩子得了一場病，或者發生了一場意外事故，在家休養了幾周，重新回到學校，對很多方面難以適應。
2.在學校受嘲笑、被輕視 在家里，他處處都得到歡迎，什么都不缺。但在學校缺乏交際能力，導致受嘲笑、被輕視。
3.發生重大改變 孩子的個人或者家庭生活發生重大改變，如：搬家轉學，自己患嚴重疾病，或者父母、同胞患嚴重疾病或死亡。
4.家庭問題 父母離異、經濟問題、父母再婚或者新同胞的來臨，導致家庭生活不穩定或氣氛壓抑。
5.在學校遇上麻煩事情 孩子進入青春期后，如果出現拒絕上學的情況，可能是在學校遇上了嚴重的麻煩事情。經常地受到某些威脅或恐嚇。在學校或者去上學的路上，受到其他同學的人身威脅。或者是面對學校一些活動，感到力不從心、要求過高，甚至覺得要求苛刻。盡管學校恐怖癥與焦慮的關系比與恐懼的關系大一些，但是因受威脅而造成的恐懼可以加重焦慮。
二、發病機制
學校恐怖癥屬特殊環境(學校)下的精神障礙。目前國外學者把學校恐怖癥列為常見的一種情緒障礙，并認為發病年齡有3個高峰，且與發生原因密切相關：5～7歲為第一高峰，可能與分離性焦慮有關;11～12歲為第二高峰，可能與升中學、功課增多、壓力加大或改換學校重新適應新環境和人際交往困難等因素有關;14歲為第三高峰，可能與少年特征性發育，自覺身材長高，手足長大，顯得不靈活，情緒抑郁有關。
