本病需與以下疾病鑒別
1.脊髓灰質炎：發熱數日后, 體溫未完全恢復正常時出現癱瘓，常累及一側下肢，無感覺障礙和腦神經受累。病后3周可見CSF細胞蛋白分離, 注意鑒別。
2.低血鉀性麻痹：GBS多有病前感染史和自身免疫反應，低血鉀型周期性癱瘓則有低血鉀、甲亢病史。前者急性或亞急性起病, 進展不超過4周，四肢癱常自雙下肢開始,近端較明顯，后者起病快(數小時~1天),恢復快(2~3天)，四肢弛緩性癱。GBS可有呼吸肌麻痹、腦神經受損、感覺障礙(末梢型)及疼痛，低血鉀型周期性癱瘓無。GBS腦脊液蛋白細胞分離，電生理檢查早期F波或H反射延遲,運動NCV減慢，低血鉀型周期性癱瘓正常，電生理檢查EMG電位幅度降低,電刺激可無反應。GBS血鉀正常，低血鉀型周期性癱瘓血鉀低, 補鉀有效。
3.功能性癱瘓：根據神經體征不固定、腱反射活躍和精神誘因等鑒別。
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