粒細胞減少癥需從下列方面進行鑒別。
1.繼發性粒細胞缺乏癥的病因鑒別 前述八大類原因，根據病史及臨床表現一般不難鑒別。但藥物誘發者，有時要確定為某一藥物所致，會有一定難度，因為患者可能同時或先后使用多種藥物。鑒別意義在于今后究竟應終身禁用哪一種藥物。
2.各種先天性粒細胞減少癥的鑒別 根據粒細胞減少的程度，可確定為良性或嚴重性粒細胞減少;周期性規律發作者，最易明確診斷;各種綜合征伴發的粒細胞減少，則可根據各自的臨床特點及實驗室檢查結果區分。此外，發病年齡對診斷也有一定的參考意義。
3.粒細胞減少并發感染與感染誘發的粒細胞減少的鑒別 非感染原因引發的粒細胞減少癥，其粒細胞減少發生在前，感染并發在后;感染誘發的粒細胞減少，則反之。非感染原因引起的粒細胞減少癥，如并發感染，大多還有明確的原發病。
4.粒細胞缺乏癥恢復期和急性白血病鑒別 粒細胞缺乏癥恢復期患者，主要是骨髓象(有時也累及血象)可出現較多粒系早期細胞，包括原始及早幼粒細胞，有時可超過30%，酷似急性髓細胞白血病。鑒別點：①前者有粒細胞缺乏癥的病史，以及原發病或用藥史。②無淋巴結、肝、脾大等白血病浸潤的體征。③通常無貧血和(或)血小板減少。④短期動態觀察，骨髓及外周血早期粒系細胞逐漸減少及消失。
