必須與下列疾病作鑒別。
1.強直性脊柱炎 本病好發于40歲以下男性，不滿20歲發病的更為多見，也有腰痛與腰椎強直，血細胞沉降率增快，很容易與脊柱結核混淆不清。但本病100%有骶髂關節炎癥。沒有全身中毒癥狀，X線檢查看不到骨破壞與死骨，胸椎受累后會出現胸廓擴張受限等臨床表現，足以鑒別。
2.化膿性脊柱炎 化膿性脊柱炎發病急，有高熱及明顯疼痛，進展很快，早期血培養可檢出致病菌。X線表現進展快，其特征性X線表現可資鑒別。鑒別要點見表1。
3.腰椎間盤突出 腰椎間盤突出無全身癥狀，有下肢神經根受壓癥狀，血細胞沉降率不快。X線片上無骨質破壞，CT檢查可發現突出的髓核。其鑒別要點見表2。
4.脊柱腫瘤 脊柱腫瘤多見于老年人，疼痛逐天加重，X線片上可見骨破壞累及椎弓根，椎間隙高度正常，一般沒有椎旁軟組織腫塊影。其鑒別要點見表3。
5.嗜酸性肉芽腫 嗜酸性肉芽腫多見于胸椎，患者年齡通常不滿12歲，整個椎體被均勻性壓扁成線條狀，上、下椎間隙完全正常。沒有發熱等全身癥狀。
6.退行性脊椎骨關節病 退行性脊椎骨關節病為老年性疾病，有普遍性椎間隙變窄，鄰近椎體上下緣硬化發白，有骨橋形成，沒有骨質破壞與全身癥狀。
