1、鼻咽部淋巴肉瘤
淋巴肉瘤好發于青年人，原發腫瘤較大，常有較重鼻塞及耳部癥狀，該病淋巴結轉移，不單局限在頸部，全身多處淋巴結均可受累，顱神經的損傷不如鼻咽癌多見，最后需要病理確診。
2、增生性病變
鼻咽頂壁、頂后壁或頂側壁見單個或多個結節，隆起如小丘狀，大小約0.5～1cm，結節表面粘膜呈淡紅色，光滑，多是在鼻咽粘膜或腺樣體的基礎上發生，亦可由粘膜上皮鱗狀化生后，角化上皮潴留而形成表皮樣囊腫的改變，部分是粘膜腺體分泌旺盛，形成潴留性囊腫。當結節表面的粘膜出現粗糙、糜爛、潰瘍或滲血，需考慮癌變的可能，應予活檢，以明確診斷。
3、鼻咽部結核，患者多有肺結核病史，除鼻阻、涕血外，還有低熱，盜汗、消瘦等癥，檢查見鼻部潰瘍、水腫、顏色較淡;分泌物涂片，可找到抗酸桿菌，可伴有頸淋巴結核;淋巴結腫大，呈馬鈴狀，粘連，無壓痛，頸淋巴結穿刺可找到結核核菌，CT試驗強陽性，X線胸片常提示肺部活動性結核灶。
4、咽粘膜炎癥 表現為粘膜粗糙，尤其是重度炎癥時，鼻咽粘膜濾泡增殖，表面凹凸，甚至可呈桑椹樣，表面附有膿性分泌物，常需與粘膜浸潤性癌相鑒別。
5、過敏性鼻炎 鼻咽粘膜蒼白、光滑呈水腫樣。
6、 萎縮性鼻炎 鼻咽頂前粘膜有淺在性潰瘍，周圍有膿性分泌物，需與潰瘍型鼻咽癌鑒別。
