一、大便常規：
大便常規的檢驗目的主要有了解消化道有無細菌感染以及寄生蟲感染和潛血試驗。
二、外周血：
外周血是除骨髓之外的血液，臨床上常用一些方法把骨髓中的造血干細胞釋放到血液中，再在從血液中提取分離得到造血干細胞，我們把這樣得到的干細胞成為外周血干細胞。
必要時查白細胞及分類以除外炎癥感染。
三、X線檢查：
腹部平片以觀察腸淤脹與游離氣體。必要時做鋇餐或鋇灌腸以觀察有無潰瘍、胃炎、十二指腸炎、腸粘連、腸梗阻或憩室。
四、胃鏡檢查：
胃鏡檢查的全名為“上消化道內視鏡檢查”，它是利用一條直徑約一公分的黑色塑膠包裹導光纖維的細長管子，前端裝有內視鏡由嘴中伸入受檢者的食道→胃→十二指腸，藉由光源器所發出之強光，經由導光纖維可使光轉彎，讓醫師從另一端清楚地觀察上消化道內各部位的健康狀況。
必要時，可由胃鏡上的小洞伸入夾子做切片檢查。全程檢查時間約10分鐘，若做切片檢查，則需20至30分鐘。對于慢性反復發作的腹痛進行胃鏡檢查有助于全面發現胃部病變如胃炎、十二指腸炎、潰瘍病等。
五、胃電圖檢查：
因是無創性檢查患兒易于接受，但所得結果特異性不強，僅能作參考。
六、幽門螺桿菌檢查：
幽門螺桿菌感染是慢性活動性胃炎、消化性潰瘍、胃黏膜相關淋巴組織(MALT) 淋巴瘤和胃癌的主要致病因素。1994年世界衛生組織/國際癌癥研究機構 (WHO/IARC) 將幽門螺桿菌定為Ⅰ類致癌原。
對慢性反復發作腹痛有密切關系，如發現幽門螺桿菌應給予治療。
七、胃動力學檢查：
如食管與十二指腸測壓、實時超聲、胃排空試驗，有助于發現消化道動力障礙。
