成都中醫藥大學第二臨床醫學院/第二附屬醫院于2007年正式成立。2006年四川省衛生干部管理學院、四川生殖衛生學院并入成都中醫藥大學整合組建。四川省衛生干部管理學院創建于1938年的四川省立成都高級醫事職業學校, 四川生殖衛生學院則由四川省計劃生育研究所（1978年成立）和成都婦幼保健與計劃生育專門人員培訓中心（1980年成立）合并而成。

目前醫院為聯合國世界衛生組織人類生殖研究合作中心、聯合國人口基金南南合作培訓中心、四川省人口和計劃生育科學研究所和四川省生殖保健服務中心，以培養臨床醫學和生殖醫學高素質應用型醫學人才為目標，致力于醫學研究和服務社會。

學院以西醫臨床人才培養為主體，辦學層次以本科為主，兼研究生教育和專科教育。開設臨床醫學專業及臨床醫學專業（全科方向），2007年開始招收臨床醫學專業（本科），多年來為基層醫療機構，科研、教學和婦幼保健等單位培養了大批從事臨床醫療、預防保健等工作的高素質應用型醫學人才；2010年取得臨床醫學一級學科碩士學位授予點。每年招收本專科學生400余人，招收研究生20余人，現有研究生、本專科學生和成教學生共計2400余人，其中農村定向免費臨床醫學本專科學生600人。

學院現有教職員工167人，其中高級職稱42人，中級職稱41人，初級職稱68人；博士生導師2人，碩士生導師9人（含兼職導師）；其中享受國務院特殊津貼4人，四川省有突出貢獻專家3人；四川省學術技術帶頭人3人；國家教育部重點學科帶頭人1人。形成了一批以專家為學術帶頭人，中青年骨干為主的教學、科研、臨床專業人才隊伍，具備較強的理論教學、科學研究和臨床實踐實力。

“十二五”以來(2011-2014)，學院承擔了國家自然科學基金、973項目、財政部行業專項、國家衛生和計劃生育委員會等各級各類科研課題91項，到位科研經費近千萬；發表論文170余篇，其中SCI源刊論文12篇。學院現有國家重點學科2個建設方向和校級重點學科1個。

學院以“立德樹人”為中心，重視學生綜合素質的培養與提高。不斷開拓進取，積極探索大學生思想政治教育的新思路，堅持“讓學生明確發展方向，讓學生得到發展機會，讓學生增強發展動力”的素質教育理念。作為學校的大學生心理健康教育特色基地，抓理想信念、育健康人格、促健康成人、保順利成才，真心幫助學生成長，耐心解決學生困難，熱心方便學生辦事，公心維護學生權益。以培養學生創新力及崗位素質需求為導向，搭建科學技術、社會實踐、文化體育“三位一體”的綜合素質培養平臺，開展系列科技學術活動和文體藝術活動，致力于為社會培養全面發展、基礎扎實、知識面寬、能力強、素質高的應用型臨床醫學人才。

該院畢業生就業情況：就業態勢良好，專業對口率高,就業去向為各級醫療衛生單位。2013年一次性就業率97.16%，專業對口率93.37%；2014年一次性就業率95.34%，專業對口率93.5%。其中，畢業生中考上北京大學、武漢大學、四川大學、第三軍醫大學、中國醫科大學等知名高校的研究生111名；參加四川大學華西醫學院、四川省人民醫院、成都陸軍總醫院等醫院的規范化醫師培養的畢業生56名；到成都軍區、中國人民解放軍武警部隊、中國人民解放軍東海艦隊等部隊就業的畢業生27名。

第二附屬醫院是經四川省衛生廳批準，以中西醫生殖保健、優生優育、婦幼保健為特色優勢的醫療機構，是省級唯一的計劃生育服務機構，2006年經衛生部批準成為開展“體外受精-胚胎移植”和“卵胞漿內單精子顯微注射技術”試管嬰兒技術的醫療機構。醫院設有生殖醫學中心、內科、中西醫結合科、外科、婦科、中醫科、兒科、皮膚科、醫療美容科、口腔科、麻醉科、醫學檢驗科、醫學影像科、體檢科等科室，擁有一批國內外知名教授為代表的臨床醫學、預防保健和中西醫結合專家。在男性節育技術、輔助生殖技術領域研究方面，一直處于世界先進水平。目前為“四川省中西醫結合學會婦產科專委會”、“四川省性學會男性學專委會”、“成都市中醫學會婦科專委會”主任委員單位。

學院積極開展國際交流與合作，負責開展計劃生育及生殖醫學技術國際培訓工作：先后培養全國各類計劃生育干部和社區醫療衛生人員20000余人。受聯合國人口基金(UNFPA)、世界衛生組織(WHO)和美國自愿手術絕育協會(AVSC)等國際組織委托，舉辦國際培訓班。