心臟瓣膜病的病因有先天性及后天性兩類。
先天性：即出生時已發現瓣膜病變，如部分病人主動脈瓣只有兩葉，比正常少了一葉，病變的主動脈瓣開放不全，影響血液流通。
后天性：大致有感染、退化及其它疾病引發。
A.感染：細菌通過血液到達心臟內部并侵犯瓣膜。使用靜脈注射的吸毒者以及瓣膜原先已有問題者(較厚或鈣化)容易發生。
B.退化：隨年齡漸長，瓣膜會逐漸退化，以主動脈瓣最常見。
C.其它：主要指風濕性心臟病。由于鏈球菌感染，繼而引發免疫反應而破壞心臟瓣膜。
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