小兒睪丸扭轉可以并發如下疾病：睪丸萎縮、壞死，影響生育和內分泌等。
睪丸萎縮：睪丸萎縮，是指男子睪丸縮小痿軟之一種病證，也稱“子萎”，以一例或雙側睪丸萎縮，既小又軟為特征，大多數能引起不育。目前常采用國際通用的睪丸體積測量器測量睪丸體積，中國人的睪丸大小范圍是15—25號，臨床上常以小于12號 者診斷為“睪丸萎縮”。除了測量睪丸的體積大小外，還必須注意睪丸的質地，如睪丸質地變軟，表明受損程度較重，另外進行精液檢查對診斷也有很大幫助，但是診斷睪丸萎縮最準確的方法還是睪丸活檢。
睪丸壞死：當出現睪丸萎縮的情況而不進行及時處理的話，則會引發睪丸壞死。
不育：男性不育癥是指由于男性因素引起的不育。一般把婚后同居2年以上未采取任何避孕措施而女方未懷孕，稱為不育癥。發生率為10%左右。
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